Národné centrum zdravotníckych informácií zbiera a spracováva vybrané údaje o zdravotnom stave obyvateľstva, o sieti a činnosti poskytovateľov zdravotnej starostlivosti a iných organizácií, o pracovníkoch, o ekonomike zdravotníctva vrátane financovania zdravotnej starostlivosti poskytovanej na základe zdravotného poistenia, zdravotníckej technike atď. Zabezpečuje úlohy a činnosti súvisiace s vedením, aktualizáciou a spracúvaním údajov národných zdravotných registrov.
Získané a spracované informácie poskytuje v požadovanej forme, rozsahu a štruktúre Ministerstvu zdravotníctva SR, Štatistickému úradu SR, hlavným odborníkom MZ SR ako aj zahraničným užívateľom WHO, OECD, Eurostat.
Vykazovacia povinnosť pre spravodajské jednotky vyplýva z:
- § 18 zákona č. 540/2001 Z. z. o štátnej štatistike v znení neskorších predpisov a je realizovaná prostredníctvom Vyhlášky Štatistického úradu SR č. 358/2011 Z.z., ktorou sa vydal Program štátnych štatistických zisťovaní na roky 2012 až 2014.
- § 44 zákona č. 576/2004 Z. z. o zdravotnej starostlivosti, službách súvisiacich s poskytovaním zdravotnej starostlivosti v znení neskorších predpisov.