Ťažisko činnosti NCZI v oblasti štandardov informačnej sústavy zdravotníctva je zamerané na:
- definovanie štandardov, integračných nástrojov (centrálnych číselníkov, klasifikácií, protokolov a rozhraní) a pravidiel komunikácie medzi zdravotníckymi informačnými systémami
- aktualizáciu štandardov a vedenie katalógu štandardov
- vykonávanie štandardizačnej a metodickej činnosti pre proces informatizácie v zdravotníctve
- zavádzanie a aplikáciu medzinárodných štandardov a noriem, vyplývajúcich z rozhodnutí a uznesení orgánov EÚ, medzinárodných dohovorov a zmlúv záväzných pre zdravotníctvo
- tvorbu jednotnej údajovej referenčnej základne rezortu zdravotníctva, jej prevádzku a ďalší vývoj
- v oblasti klinickej terminológie v spolupráci s klinickými odborníkmi na zabezpečovanie prevádzky databáz informácií a odbornej terminológie, primárne zameranej na adopciu SNOMED CT v SR
- prevádzku a aktualizáciu národných administratívnych registrov – Národného registra poskytovateľov zdravotnej starostlivosti ( NR PZS) a Národného registra zdravotníckych pracovníkov (NR ZP)
- zabezpečovanie tvorby stratégie a koncepcie metodiky pre NR PZS a NR ZP
« späť